Baía Formosa é um santuário ecológico, suas praias são ninhos de tartarugas marinhas, os peixes boi sempre visitam a região, os botos dão um show quase todos os dias de manhã, mesmo dentro da cidade podem ser encontrados sagüis, várias aves e até tamanduás.

A Mata Estrela é o grande destaque em Baía Formosa, é a maior reserva de mata atlântica sobre dunas do Brasil, com 2365 hectares, composta por 1888,79 de florestas, 81,64 de dunas e 69,73 só de lagoas. A Mata margeia toda a extensão litorânea de Baía Formosa e é um convite irrecusável para os amantes da natureza.

Com a explosão do ecoturismo no Brasil, Baía Formosa vem se tornando um dos mais procurados e atraentes pontos turísticos do Rio Grande do Norte, principalmente para quem curte um tipo muito especial de passeio, onde há um contato direto com a natureza. É possível conhecer seus atrativos naturais de mountain bike, a pé ou a cavalo em trilhas cercada por exuberante flora, onde podem ser facilmente encontrados o pau-brasil, a gameleira e o jatobá; e uma diversificada fauna, composta por diversos animais em seu habitat natural, tais como: tamanduás, sagüis, cotias, muitas aves e um dos poucos lugares de mata atlântica no Brasil onde pode-se encontrar o macaco Guariba.

Entre as muitas gigantescas árvores da Mata Estrela, destaca-se uma Gameleira centenária, com quase 30 metros de altura. Sua copa equivale a um ginásio de esportes e são necessárias 8 pessoas de mãos dadas para abraçar seu tronco.

As lagoas de Baía Formosa também merecem um destaque especial, são inúmeras por entre as dunas e a Mata, de água doce, morna e muita limpa. A principal delas é a Lagoa Araraquara, conhecida popularmente como Lagoa da Coca-cola, por ter uma coloração escura, quase vermelha, fruto da pigmentação das raízes e componentes do solo. Diz a lenda, que um banho em suas águas é rejuvenescedor e purificante. Esta é ponto de parada obrigatória nos passeios de buggy.